Em geral, isso é muito dificil de conseguir em sistemas Unix em razão da sua natureza multitarefa. Funções de recuperação estão em desenvolvimento, mas não espere grandes resultados.
Há uns poucos pacotes disponíveis que funcionam oferecendo novos comandos para apagamento (e em alguns casos cópia) que movem os arquivos "apagados" para um diretório "lixeira"; esses arquivos podem ser entao recuperados, até que sejam apagados automaticamente por processos em segundo plano..
Outra alternativa é a busca direta na própria unidade de disco que contém o sistema de arquivos em questão. Esse é um trabalho difícil, e você precisa estar como root para isso.